MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 40984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015508	GC	3	6	237475	237480	0 %	0 %	50 %	50 %	332715596
4502	NC_015508	ATTC	2	8	237509	237516	25 %	50 %	0 %	25 %	332715596
4503	NC_015508	CTT	2	6	237674	237679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715597
4504	NC_015508	GCC	2	6	237691	237696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715597
4505	NC_015508	AGC	2	6	237746	237751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715597
4506	NC_015508	CGT	2	6	237765	237770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715597
4507	NC_015508	CCG	2	6	237785	237790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715597
4508	NC_015508	TTC	2	6	237799	237804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715597
4509	NC_015508	ATGCCG	2	12	237907	237918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332715597
4510	NC_015508	C	6	6	237941	237946	0 %	0 %	0 %	100 %	332715597
4511	NC_015508	CGA	2	6	237980	237985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715597
4512	NC_015508	GCG	2	6	238005	238010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715597
4513	NC_015508	GGCGC	2	10	238106	238115	0 %	0 %	60 %	40 %	332715597
4514	NC_015508	GCC	3	9	238156	238164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715597
4515	NC_015508	TCT	2	6	238183	238188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715597
4516	NC_015508	GAT	2	6	238200	238205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715597
4517	NC_015508	ATC	2	6	238225	238230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715597
4518	NC_015508	TCG	2	6	238363	238368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715597
4519	NC_015508	GT	3	6	238396	238401	0 %	50 %	50 %	0 %	332715597
4520	NC_015508	GCG	2	6	238418	238423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715597
4521	NC_015508	AGT	2	6	238475	238480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715597
4522	NC_015508	CGG	2	6	238685	238690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715597
4523	NC_015508	TCCGC	2	10	238702	238711	0 %	20 %	20 %	60 %	332715597
4524	NC_015508	CG	3	6	238734	238739	0 %	0 %	50 %	50 %	332715597
4525	NC_015508	GCA	2	6	238762	238767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715597
4526	NC_015508	CG	3	6	238850	238855	0 %	0 %	50 %	50 %	332715597
4527	NC_015508	GCC	2	6	238881	238886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715597
4528	NC_015508	GC	3	6	238970	238975	0 %	0 %	50 %	50 %	332715597
4529	NC_015508	CTGG	2	8	239034	239041	0 %	25 %	50 %	25 %	332715597
4530	NC_015508	CCG	2	6	239050	239055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715597
4531	NC_015508	GCC	3	9	239113	239121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715597
4532	NC_015508	CGC	2	6	239123	239128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715597
4533	NC_015508	CCA	2	6	239134	239139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715597
4534	NC_015508	CGT	2	6	239174	239179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715598
4535	NC_015508	TTG	2	6	239190	239195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715598
4536	NC_015508	CGGC	2	8	239379	239386	0 %	0 %	50 %	50 %	332715598
4537	NC_015508	CGC	2	6	239506	239511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715598
4538	NC_015508	GAT	2	6	239516	239521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715598
4539	NC_015508	GCAAG	2	10	239566	239575	40 %	0 %	40 %	20 %	332715598
4540	NC_015508	CGC	2	6	239579	239584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715598
4541	NC_015508	CCG	2	6	239632	239637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715598
4542	NC_015508	CAT	2	6	239678	239683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715598
4543	NC_015508	CAA	2	6	239692	239697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715598
4544	NC_015508	GCA	2	6	239712	239717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715598
4545	NC_015508	CGC	2	6	239722	239727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715598
4546	NC_015508	TCG	2	6	239754	239759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715598
4547	NC_015508	A	6	6	239878	239883	100 %	0 %	0 %	0 %	332715598
4548	NC_015508	GTT	2	6	239891	239896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715598
4549	NC_015508	CAG	3	9	239915	239923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715598
4550	NC_015508	CTG	2	6	239936	239941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715598
4551	NC_015508	GAA	2	6	239978	239983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715598
4552	NC_015508	AGGC	2	8	240004	240011	25 %	0 %	50 %	25 %	332715598
4553	NC_015508	GCG	2	6	240056	240061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715598
4554	NC_015508	CG	3	6	240060	240065	0 %	0 %	50 %	50 %	332715598
4555	NC_015508	GC	3	6	240151	240156	0 %	0 %	50 %	50 %	332715598
4556	NC_015508	CTGA	2	8	240182	240189	25 %	25 %	25 %	25 %	332715598
4557	NC_015508	ACA	2	6	240615	240620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715599
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4559	NC_015508	GAC	2	6	240728	240733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715599
4560	NC_015508	GCA	2	6	240735	240740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715599
4561	NC_015508	AGAT	2	8	240804	240811	50 %	25 %	25 %	0 %	332715599
4562	NC_015508	GAT	2	6	240829	240834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715599
4563	NC_015508	CTCG	2	8	240890	240897	0 %	25 %	25 %	50 %	332715599
4564	NC_015508	GCG	2	6	240965	240970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715599
4565	NC_015508	CGC	2	6	241000	241005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715599
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4569	NC_015508	ATC	2	6	241576	241581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715600
4570	NC_015508	GCCGGT	2	12	241582	241593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332715600
4571	NC_015508	CGC	2	6	241657	241662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715600
4572	NC_015508	CTG	2	6	241666	241671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715600
4573	NC_015508	CGT	2	6	241708	241713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715600
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4575	NC_015508	TGGAC	2	10	241836	241845	20 %	20 %	40 %	20 %	332715600
4576	NC_015508	CTGAT	2	10	241880	241889	20 %	40 %	20 %	20 %	332715600
4577	NC_015508	CG	3	6	241970	241975	0 %	0 %	50 %	50 %	332715600
4578	NC_015508	GAAA	2	8	241998	242005	75 %	0 %	25 %	0 %	332715600
4579	NC_015508	GAA	2	6	242041	242046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715600
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4591	NC_015508	TGC	2	6	242780	242785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715600
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4601	NC_015508	GCT	2	6	243141	243146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715600
4602	NC_015508	CATT	2	8	243174	243181	25 %	50 %	0 %	25 %	332715600
4603	NC_015508	GCT	2	6	243291	243296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715600
4604	NC_015508	CG	3	6	243311	243316	0 %	0 %	50 %	50 %	332715600
4605	NC_015508	TGC	2	6	243428	243433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715600
4606	NC_015508	AGCGC	2	10	243482	243491	20 %	0 %	40 %	40 %	332715600
4607	NC_015508	GCA	2	6	243492	243497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715600
4608	NC_015508	GC	3	6	243515	243520	0 %	0 %	50 %	50 %	332715600
4609	NC_015508	ATC	2	6	243591	243596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715601
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4611	NC_015508	GTG	2	6	243696	243701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715601
4612	NC_015508	CCGT	2	8	243750	243757	0 %	25 %	25 %	50 %	332715601
4613	NC_015508	GATCT	2	10	243780	243789	20 %	40 %	20 %	20 %	332715601
4614	NC_015508	CGA	2	6	243884	243889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715601
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4619	NC_015508	CGG	2	6	244141	244146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715601
4620	NC_015508	ACGGC	2	10	244157	244166	20 %	0 %	40 %	40 %	332715601
4621	NC_015508	ACA	2	6	244246	244251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715601
4622	NC_015508	AGA	2	6	244313	244318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715601
4623	NC_015508	CGA	2	6	244337	244342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715601
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4630	NC_015508	CG	3	6	245264	245269	0 %	0 %	50 %	50 %	332715602
4631	NC_015508	CG	3	6	245391	245396	0 %	0 %	50 %	50 %	332715602
4632	NC_015508	CGG	2	6	245409	245414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715602
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4634	NC_015508	TCC	2	6	245441	245446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715602
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4642	NC_015508	CTC	2	6	245818	245823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715602
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4743	NC_015508	TCG	2	6	250434	250439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715606
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4766	NC_015508	TGG	2	6	252207	252212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715607
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4862	NC_015508	GCA	2	6	258178	258183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715614
4863	NC_015508	GCC	2	6	258233	258238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715614
4864	NC_015508	CTC	2	6	258293	258298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715614
4865	NC_015508	CGA	2	6	258302	258307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715614
4866	NC_015508	ACC	2	6	258316	258321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715614
4867	NC_015508	CAT	2	6	258323	258328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715614
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4869	NC_015508	CAT	2	6	258368	258373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715614
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4871	NC_015508	GCG	2	6	258768	258773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715614
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4874	NC_015508	CG	3	6	258857	258862	0 %	0 %	50 %	50 %	332715614
4875	NC_015508	AAT	2	6	258889	258894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715614
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4879	NC_015508	CTG	2	6	259051	259056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715614
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4882	NC_015508	TTC	2	6	259179	259184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715614
4883	NC_015508	GCC	2	6	259224	259229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715614
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4978	NC_015508	AAAG	2	8	265693	265700	75 %	0 %	25 %	0 %	332715620
4979	NC_015508	TGC	2	6	265734	265739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715620
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4982	NC_015508	A	6	6	265972	265977	100 %	0 %	0 %	0 %	332715620
4983	NC_015508	AAT	2	6	266014	266019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715620
4984	NC_015508	GCA	2	6	266093	266098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715620
4985	NC_015508	GTC	2	6	266113	266118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715620
4986	NC_015508	GCA	2	6	266151	266156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715620
4987	NC_015508	ATC	2	6	266366	266371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715620
4988	NC_015508	ACG	2	6	266434	266439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715620
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4990	NC_015508	CTG	2	6	266467	266472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715620
4991	NC_015508	CATC	2	8	266481	266488	25 %	25 %	0 %	50 %	332715620
4992	NC_015508	ACA	2	6	266523	266528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715620
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